El plugin Sublime Style Column Selection permite agregar esta funcionalidad.
Sin embargo, no usa Alt+click para la selección sino Shift+click.
Si se desea usar Alt+click en Ubuntu, hay algunas cosas que corregir antes. Resulta que Alt+click esta reservado por el sistema para mover las ventanas. Para cambiar eso, se puede usar dconf-tools: How do I disable window move with alt + left mouse button in GNOME Shell?
Por otro lado, Alt es usado por el desktop Unity para invocar comandos (igual que Alt+F2) y es un poco molesto porque otras aplicaciones (como Atom) podrían darle mejor uso. Para deshabilitar Alt como invocador de comandos: How do I modify or disable the HUD's use of the Alt key?